临床上没有明确表明肛周尖锐湿疣患者可以使用何种药物进行治疗。通常情况下，可遵医嘱选择具有清热解毒、活血化瘀等功效的中药内服或外洗来缓解症状，如金银花颗粒、大黄蛰虫丸等；也可在医生指导下服用阿昔洛韦片、盐酸伐昔洛韦胶囊等抗病毒类西药。
一、中药
1.金银花颗粒：主要由忍冬藤、忍冬花等成分组成，有清热解毒的功效，可用于改善急性咽炎、上呼吸道感染引起的咽喉肿痛等症状。如果出现上述不适症状，可在医生指导下合理使用该药物进行治疗。
2.大黄蛰虫丸：主要是由土鳖虫、全蝎等中药材制作而成的一种中成药，具有活血破瘀的作用，常用于改善因气血淤滞所致的闭经以及症瘕积聚等情况。但对于孕妇，则不建议使用此药物，以免引起流产的情况发生。
3.其他：还可遵医嘱使用复方黄柏液涂剂、皮肤康洗液等清洗局部，促进创面愈合，有利于病情恢复。
二、西药
1.抗病毒类：若是由病毒感染所导致的疾病，在必要时则需要遵医嘱配合使用抗病毒类药物一起治疗，比如阿昔洛韦片、利巴韦林颗粒等。
2.增强免疫力类：对于自身免疫功能较差的人群，单纯通过以上方法并不能完全疾病，因此还需要遵从医嘱口服匹多莫德口服溶液、脾氨肽口服冻干粉等药物进行调理，能够使身体尽快恢复健康。
除此之外，还可以遵医嘱使用消痔栓、红霉素软膏等药物。但需要注意的是，由于肛门处存在一定的黏膜组织，并且还经常受到粪便刺激，所以用药期间还需注意保持局部清洁卫生，避免进食辛辣刺激性食物，以免影响到疾病的恢复。
